Thomas BECKING

Ingénieur d’Etudes

Master « Biologie, Ecologie, Evolution », Université de Poitiers, 2014.

Doctorat, Université de Poitiers (France), 2017.

Thèse

Directeurs de thèse : Richard Cordaux, Clément Gilbert

Impact des bactéries endosymbiotiques féminisantes du genre Wolbachia sur l’évolution des chromosomes sexuels d’isopodes terrestres

Mots clés : Déterminisme du sexe, hétérogamétie, chromosomes sexuels, gènes à domaine DM, séquençage à haut-débit, génomique évolutive.

Résumé

Les crustacés isopodes terrestres présentent une diversité remarquable de systèmes chromosomiques de déterminisme du sexe (hétérogamétie mâle XX/XY ou hétérogamétie femelle ZW/ZZ), dont l’origine reste encore largement inconnue à ce jour. Il a été proposé que ces différents systèmes puissent être le produit de la coévolution entre les isopodes terrestres et Wolbachia, une bactérie endosymbiotique féminisante transmise verticalement par voie ovocytaire.

            Mon travail vise à caractériser la diversité des stades de différenciation morphologique des chromosomes sexuels de plusieurs espèces de crustacés isopodes terrestres infectées ou non par des Wolbachia, ainsi que les forces évolutives s’exerçant sur ces chromosomes. Les résultats obtenus contribueront à évaluer les conséquences de l’endosymbiose sur l’évolution de la structuration et de la complexité des génomes hôtes, mais aussi à caractériser les mécanismes de transitions entre systèmes de déterminisme du sexe. Cette étude est basée sur une combinaison de plusieurs approches complémentaires : analyses bioinformatiques (génomique comparative à partir de données de type Illumina, PacBio), expériences de réversion du sexe, l’étude de la transcription de gènes candidats du déterminisme du sexe (au cours du développement), etc.

Publication

  • Grandjean F., Roques J., Delaunay C., Petrusek A., Becking T., Collas M. Status of Pacifastacus leniusculus and its role in recent crayfish plague outbreaks in France : improving distribution and crayfish plague infection patterns. (2017) Aquatic Invasions, 12(4): 541-9.
  • Becking T., Giraud I, Raimond M., Moumen B., Chandler C., Cordaux R., Gilbert C. Diversity and evolution of sex determination systems in terrestrial isopods. (2017) Scientific Reports, 7(1):
  • Collas M., Becking T., Delpy M., Pflieger M., Bohn P., Reynolds J., Grandjean F. Monitoring of crayfish population of Austropotamobius pallipes during a plague outbreak followed by rescue. (2016) Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems. 417:
  • Metegnier G., Becking T., Chebbi M. A., Giraud I., Moumen B., Shaack S., Cordaux R., Gilbert C. Comparative paleovirological analysis of crustaceans identifies multiple widespread viral groups (2015). Mobile DNA, 6(1):
  • Becking T., Mrugala A., Delaunay C., Svoboda J., Raimond M., Viljama-Dirks S., Petrusek A., Grandjean F., Braquart-Varnier C. Effect of experimental exposure to differently virulent Aphanomyces astaci strains on the immune response of the noble crayfish Astacus astacus (2015). Journal of invertebrate Pathology, 132: 115-24.

Coordonnées

Tél : +33 (0)5 49 36 62 46

Fax : +33 (0)5 49 45 40 15

Email : thomas.becking@univ-poitiers.fr

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