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L’ensemble des travaux de l’équipe EES est mené selon trois thèmes de recherche étroitement liés et complémentaires :

Impact évolutif de la symbiose

Ce thème de recherche concerne la compréhension de la féminisation induite par les symbiontes et ses implications biologiques à différents niveaux d’analyse.

Mots-clés : déterminisme du sexe, différentiation sexuelle, féminisation, interactions moléculaires, symbiose, Wolbachia, plasticité génomique, génomique comparative, génétique évolutive.

Interactions dans l’holobionte

Ce thème de recherche concerne le dialogue moléculaire et la coévolution entre les différents partenaires au sein de l’holobionte (hôte, bactéries, virus…).

Mots-clés : immunité, symbiose, Wolbachia, invertébrés, interactions hôte-parasite, évolution, facteurs de virulence, microbiote, hologénome, éléments génétiques mobiles, transferts horizontaux, mitogénomique.

Biodiversité et agrosystèmes

Ce thème de recherche porte sur l’évolution et le fonctionnement de la biodiversité, notamment dans le contexte d’écosystèmes continentaux anthropisés.

Mots-clés: biodiversité, pratiques agricoles, bioindicateurs, espèces patrimoniales, conservation, qualité habitat, espèces invasives, écologie comportementale, éthologie, écologie chimique, stratégies de reproduction, modélisation, hétérozygotie, kin selection, choix du partenaire.