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Doctorat en Biologie Santé : « Les composantes du microbiote pulmonaire de la mucoviscidose et leurs fonctions : le point de départ pour de nouvelles stratégies thérapeutiques. » (2023)

 Profil de recherche : Je m’intéresse particulièrement à la caractérisation des interactions hôte-pathogènes par des approches de (méta-)omiques : du modèle d’étude (mise en place du modèle, préparation des échantillons) à l’analyse fonctionnelle des données pour l’élucidation des interactions hôte-pathogènes et des mécanismes sous-jacents pouvant contribuer à la dissémination des pathogènes et/ou leur pathogénicité (pipeline bio-informatique, statistiques des données, scripts).

Actuellement, j’étudie les interactions hôte-pathogène du modèle infectieux Amibe-Mycobactéries (souches environnementales, mésocosme) par protéomique et transcriptomique.

Mots-clés : omiques, interactions hôte-pathogènes, modèle infectieux, amibe, mycobactéries

 Publications représentatives

1. Hardouin, P.; Chiron, R.; Marchandin, H.; Armengaud, J.; Grenga, L. Metaproteomics to Decipher CF Host-Microbiota Interactions: Overview, Challenges and Future Perspectives. Genes 2021, 12, 892. https://doi.org/10.3390/genes12060892
2. Hardouin P, Pible O, Marchandin H, Culotta K, Armengaud J, Chiron R and Grenga L (2022) Quick and wide-range taxonomical repertoire establishment of the cystic fibrosis lung microbiota by tandem mass spectrometry on sputum samples. Front. Microbiol. 13:975883. doi: 10.3389/fmicb.2022.975883
3. Hardouin P, Hachemi H, Pible O, Marchandin H, Armengaud J, Chiron R and Grenga L. Metaproteomic Profile of the Respiratory Microbiota in Patients with Cystic Fibrosis Infected by Mycobacterium abscessus: A Tale of Two Patients. In Press